Entende-se por inovação toda ação diferenciada, exitosa ou recente, identificada especialmente quando envolve recursos tecnológicos ou se refere a alguma prática que comprovadamente apresenta êxito.
As atividades de inovação da AFYA Faculdade de Ciências Médicas de Itabuna têm por objetivo: estimular o aperfeiçoamento e o desenvolvimento de processos, produtos e tecnologias; atuar em sinergia com ambientes promotores de inovação, assim como desenvolver mecanismos de geração de empreendimentos; incentivar o empreendedorismo; fomentar a iniciação tecnológica de acadêmicos de graduação e pós-graduação das unidades de ensino; promover a interpretação e a produção de conhecimentos; contribuir para o aperfeiçoamento docente; fortalecer a qualidade do ensino ofertado; promover a transmissão dos resultados das atividades de inovação tecnológica para a sociedade.